Protein–RNA interactions for Protein: Q5RGS3

FAM74A1, Protein FAM74A1, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM74A1Q5RGS3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FAM74A1Q5RGS3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FAM74A1Q5RGS3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM74A1Q5RGS3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM74A1Q5RGS3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM74A1Q5RGS3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM74A1Q5RGS3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM74A1Q5RGS3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM74A1Q5RGS3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM74A1Q5RGS3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM74A1Q5RGS3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM74A1Q5RGS3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM74A1Q5RGS3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM74A1Q5RGS3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM74A1Q5RGS3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM74A1Q5RGS3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM74A1Q5RGS3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM74A1Q5RGS3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM74A1Q5RGS3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM74A1Q5RGS3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM74A1Q5RGS3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM74A1Q5RGS3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM74A1Q5RGS3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM74A1Q5RGS3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM74A1Q5RGS3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM74A1Q5RGS3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM74A1Q5RGS3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM74A1Q5RGS3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM74A1Q5RGS3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM74A1Q5RGS3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM74A1Q5RGS3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM74A1Q5RGS3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM74A1Q5RGS3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM74A1Q5RGS3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM74A1Q5RGS3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM74A1Q5RGS3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM74A1Q5RGS3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM74A1Q5RGS3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM74A1Q5RGS3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM74A1Q5RGS3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM74A1Q5RGS3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM74A1Q5RGS3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM74A1Q5RGS3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM74A1Q5RGS3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM74A1Q5RGS3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM74A1Q5RGS3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM74A1Q5RGS3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
FAM74A1Q5RGS3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FAM74A1Q5RGS3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FAM74A1Q5RGS3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FAM74A1Q5RGS3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FAM74A1Q5RGS3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FAM74A1Q5RGS3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FAM74A1Q5RGS3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM74A1Q5RGS3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM74A1Q5RGS3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM74A1Q5RGS3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM74A1Q5RGS3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM74A1Q5RGS3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM74A1Q5RGS3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM74A1Q5RGS3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM74A1Q5RGS3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM74A1Q5RGS3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM74A1Q5RGS3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM74A1Q5RGS3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM74A1Q5RGS3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM74A1Q5RGS3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM74A1Q5RGS3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM74A1Q5RGS3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM74A1Q5RGS3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM74A1Q5RGS3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM74A1Q5RGS3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM74A1Q5RGS3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM74A1Q5RGS3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM74A1Q5RGS3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM74A1Q5RGS3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM74A1Q5RGS3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM74A1Q5RGS3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM74A1Q5RGS3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM74A1Q5RGS3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM74A1Q5RGS3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM74A1Q5RGS3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM74A1Q5RGS3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM74A1Q5RGS3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM74A1Q5RGS3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM74A1Q5RGS3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM74A1Q5RGS3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAM74A1Q5RGS3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAM74A1Q5RGS3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAM74A1Q5RGS3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAM74A1Q5RGS3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAM74A1Q5RGS3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
FAM74A1Q5RGS3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
FAM74A1Q5RGS3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
FAM74A1Q5RGS3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
FAM74A1Q5RGS3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
FAM74A1Q5RGS3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
FAM74A1Q5RGS3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
FAM74A1Q5RGS3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAM74A1Q5RGS3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.9 ms