Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KHDC3LQ587J8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KHDC3LQ587J8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KHDC3LQ587J8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KHDC3LQ587J8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KHDC3LQ587J8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KHDC3LQ587J8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KHDC3LQ587J8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
KHDC3LQ587J8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KHDC3LQ587J8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KHDC3LQ587J8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KHDC3LQ587J8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
KHDC3LQ587J8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KHDC3LQ587J8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KHDC3LQ587J8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KHDC3LQ587J8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KHDC3LQ587J8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KHDC3LQ587J8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KHDC3LQ587J8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KHDC3LQ587J8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KHDC3LQ587J8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KHDC3LQ587J8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KHDC3LQ587J8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KHDC3LQ587J8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KHDC3LQ587J8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KHDC3LQ587J8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KHDC3LQ587J8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KHDC3LQ587J8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KHDC3LQ587J8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KHDC3LQ587J8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KHDC3LQ587J8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KHDC3LQ587J8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KHDC3LQ587J8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KHDC3LQ587J8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KHDC3LQ587J8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KHDC3LQ587J8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KHDC3LQ587J8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KHDC3LQ587J8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KHDC3LQ587J8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KHDC3LQ587J8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KHDC3LQ587J8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KHDC3LQ587J8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KHDC3LQ587J8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KHDC3LQ587J8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KHDC3LQ587J8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KHDC3LQ587J8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KHDC3LQ587J8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KHDC3LQ587J8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KHDC3LQ587J8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KHDC3LQ587J8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KHDC3LQ587J8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KHDC3LQ587J8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KHDC3LQ587J8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KHDC3LQ587J8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KHDC3LQ587J8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KHDC3LQ587J8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KHDC3LQ587J8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KHDC3LQ587J8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KHDC3LQ587J8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KHDC3LQ587J8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KHDC3LQ587J8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KHDC3LQ587J8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KHDC3LQ587J8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KHDC3LQ587J8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KHDC3LQ587J8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KHDC3LQ587J8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KHDC3LQ587J8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KHDC3LQ587J8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KHDC3LQ587J8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KHDC3LQ587J8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KHDC3LQ587J8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KHDC3LQ587J8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KHDC3LQ587J8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KHDC3LQ587J8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KHDC3LQ587J8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KHDC3LQ587J8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KHDC3LQ587J8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KHDC3LQ587J8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KHDC3LQ587J8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KHDC3LQ587J8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KHDC3LQ587J8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KHDC3LQ587J8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KHDC3LQ587J8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KHDC3LQ587J8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KHDC3LQ587J8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KHDC3LQ587J8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KHDC3LQ587J8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KHDC3LQ587J8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KHDC3LQ587J8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KHDC3LQ587J8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KHDC3LQ587J8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KHDC3LQ587J8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KHDC3LQ587J8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KHDC3LQ587J8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KHDC3LQ587J8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KHDC3LQ587J8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KHDC3LQ587J8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KHDC3LQ587J8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KHDC3LQ587J8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KHDC3LQ587J8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms