Protein–RNA interactions for Protein: Q15771

RAB30, Ras-related protein Rab-30, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB30Q15771 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB30Q15771 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB30Q15771 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB30Q15771 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB30Q15771 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB30Q15771 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB30Q15771 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB30Q15771 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB30Q15771 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB30Q15771 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB30Q15771 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB30Q15771 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB30Q15771 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB30Q15771 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB30Q15771 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB30Q15771 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB30Q15771 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB30Q15771 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB30Q15771 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB30Q15771 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB30Q15771 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB30Q15771 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB30Q15771 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB30Q15771 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB30Q15771 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB30Q15771 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB30Q15771 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB30Q15771 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB30Q15771 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB30Q15771 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB30Q15771 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB30Q15771 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB30Q15771 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB30Q15771 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB30Q15771 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB30Q15771 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB30Q15771 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB30Q15771 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB30Q15771 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB30Q15771 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAB30Q15771 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAB30Q15771 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAB30Q15771 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAB30Q15771 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RAB30Q15771 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RAB30Q15771 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB30Q15771 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB30Q15771 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB30Q15771 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB30Q15771 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB30Q15771 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB30Q15771 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB30Q15771 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB30Q15771 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB30Q15771 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB30Q15771 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB30Q15771 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB30Q15771 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB30Q15771 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB30Q15771 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB30Q15771 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB30Q15771 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB30Q15771 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB30Q15771 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB30Q15771 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB30Q15771 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB30Q15771 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB30Q15771 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB30Q15771 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB30Q15771 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB30Q15771 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB30Q15771 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB30Q15771 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB30Q15771 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB30Q15771 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB30Q15771 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB30Q15771 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB30Q15771 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB30Q15771 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB30Q15771 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB30Q15771 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB30Q15771 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB30Q15771 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB30Q15771 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB30Q15771 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB30Q15771 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB30Q15771 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB30Q15771 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB30Q15771 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB30Q15771 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB30Q15771 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB30Q15771 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB30Q15771 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB30Q15771 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB30Q15771 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB30Q15771 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB30Q15771 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB30Q15771 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB30Q15771 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB30Q15771 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
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