Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PDE3BQ13370 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PDE3BQ13370 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PDE3BQ13370 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PDE3BQ13370 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PDE3BQ13370 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PDE3BQ13370 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PDE3BQ13370 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PDE3BQ13370 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PDE3BQ13370 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PDE3BQ13370 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PDE3BQ13370 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PDE3BQ13370 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PDE3BQ13370 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PDE3BQ13370 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PDE3BQ13370 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PDE3BQ13370 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PDE3BQ13370 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
PDE3BQ13370 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PDE3BQ13370 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PDE3BQ13370 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PDE3BQ13370 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PDE3BQ13370 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PDE3BQ13370 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
PDE3BQ13370 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
PDE3BQ13370 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PDE3BQ13370 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PDE3BQ13370 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PDE3BQ13370 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PDE3BQ13370 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PDE3BQ13370 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PDE3BQ13370 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PDE3BQ13370 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PDE3BQ13370 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PDE3BQ13370 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PDE3BQ13370 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PDE3BQ13370 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PDE3BQ13370 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PDE3BQ13370 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PDE3BQ13370 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PDE3BQ13370 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PDE3BQ13370 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PDE3BQ13370 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PDE3BQ13370 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PDE3BQ13370 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PDE3BQ13370 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PDE3BQ13370 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PDE3BQ13370 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PDE3BQ13370 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PDE3BQ13370 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PDE3BQ13370 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PDE3BQ13370 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PDE3BQ13370 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PDE3BQ13370 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PDE3BQ13370 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PDE3BQ13370 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PDE3BQ13370 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PDE3BQ13370 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PDE3BQ13370 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PDE3BQ13370 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PDE3BQ13370 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PDE3BQ13370 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PDE3BQ13370 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PDE3BQ13370 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PDE3BQ13370 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PDE3BQ13370 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PDE3BQ13370 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PDE3BQ13370 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PDE3BQ13370 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PDE3BQ13370 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PDE3BQ13370 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PDE3BQ13370 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PDE3BQ13370 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PDE3BQ13370 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PDE3BQ13370 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PDE3BQ13370 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PDE3BQ13370 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PDE3BQ13370 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PDE3BQ13370 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PDE3BQ13370 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PDE3BQ13370 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PDE3BQ13370 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
PDE3BQ13370 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
PDE3BQ13370 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PDE3BQ13370 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PDE3BQ13370 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PDE3BQ13370 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
PDE3BQ13370 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
PDE3BQ13370 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PDE3BQ13370 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PDE3BQ13370 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PDE3BQ13370 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PDE3BQ13370 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PDE3BQ13370 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PDE3BQ13370 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PDE3BQ13370 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PDE3BQ13370 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PDE3BQ13370 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PDE3BQ13370 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PDE3BQ13370 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
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