Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
EGR3Q06889 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EGR3Q06889 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EGR3Q06889 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
EGR3Q06889 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
EGR3Q06889 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EGR3Q06889 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EGR3Q06889 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EGR3Q06889 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EGR3Q06889 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EGR3Q06889 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EGR3Q06889 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
EGR3Q06889 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EGR3Q06889 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EGR3Q06889 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EGR3Q06889 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EGR3Q06889 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EGR3Q06889 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EGR3Q06889 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EGR3Q06889 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EGR3Q06889 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EGR3Q06889 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EGR3Q06889 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EGR3Q06889 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EGR3Q06889 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms