Protein–RNA interactions for Protein: P56199

ITGA1, Integrin alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA1P56199 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA1P56199 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA1P56199 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA1P56199 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA1P56199 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA1P56199 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA1P56199 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA1P56199 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA1P56199 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA1P56199 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA1P56199 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA1P56199 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA1P56199 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA1P56199 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA1P56199 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA1P56199 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA1P56199 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA1P56199 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA1P56199 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA1P56199 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA1P56199 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA1P56199 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA1P56199 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA1P56199 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA1P56199 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA1P56199 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA1P56199 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA1P56199 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA1P56199 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA1P56199 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA1P56199 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA1P56199 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA1P56199 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA1P56199 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA1P56199 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA1P56199 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA1P56199 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA1P56199 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA1P56199 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA1P56199 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA1P56199 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA1P56199 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA1P56199 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA1P56199 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA1P56199 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA1P56199 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA1P56199 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA1P56199 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA1P56199 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA1P56199 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA1P56199 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA1P56199 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA1P56199 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA1P56199 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA1P56199 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA1P56199 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA1P56199 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA1P56199 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA1P56199 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA1P56199 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA1P56199 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA1P56199 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA1P56199 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA1P56199 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA1P56199 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA1P56199 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA1P56199 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA1P56199 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA1P56199 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA1P56199 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA1P56199 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA1P56199 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA1P56199 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA1P56199 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA1P56199 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA1P56199 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA1P56199 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA1P56199 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA1P56199 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGA1P56199 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGA1P56199 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA1P56199 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA1P56199 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA1P56199 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA1P56199 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA1P56199 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA1P56199 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA1P56199 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA1P56199 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA1P56199 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA1P56199 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA1P56199 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA1P56199 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA1P56199 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA1P56199 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA1P56199 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA1P56199 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA1P56199 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA1P56199 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA1P56199 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms