Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
THOP1P52888 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
THOP1P52888 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
THOP1P52888 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
THOP1P52888 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
THOP1P52888 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
THOP1P52888 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
THOP1P52888 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
THOP1P52888 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
THOP1P52888 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
THOP1P52888 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
THOP1P52888 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
THOP1P52888 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
THOP1P52888 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
THOP1P52888 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
THOP1P52888 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
THOP1P52888 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
THOP1P52888 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
THOP1P52888 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
THOP1P52888 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
THOP1P52888 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
THOP1P52888 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
THOP1P52888 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
THOP1P52888 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
THOP1P52888 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
THOP1P52888 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
THOP1P52888 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
THOP1P52888 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
THOP1P52888 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
THOP1P52888 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
THOP1P52888 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
THOP1P52888 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
THOP1P52888 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
THOP1P52888 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
THOP1P52888 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
THOP1P52888 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
THOP1P52888 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
THOP1P52888 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
THOP1P52888 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
THOP1P52888 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
THOP1P52888 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
THOP1P52888 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
THOP1P52888 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
THOP1P52888 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
THOP1P52888 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
THOP1P52888 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
THOP1P52888 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
THOP1P52888 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
THOP1P52888 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
THOP1P52888 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
THOP1P52888 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
THOP1P52888 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
THOP1P52888 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
THOP1P52888 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
THOP1P52888 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
THOP1P52888 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
THOP1P52888 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
THOP1P52888 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
THOP1P52888 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
THOP1P52888 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
THOP1P52888 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
THOP1P52888 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
THOP1P52888 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
THOP1P52888 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
THOP1P52888 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
THOP1P52888 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
THOP1P52888 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
THOP1P52888 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
THOP1P52888 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
THOP1P52888 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
THOP1P52888 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
THOP1P52888 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
THOP1P52888 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
THOP1P52888 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
THOP1P52888 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
THOP1P52888 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
THOP1P52888 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
THOP1P52888 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
THOP1P52888 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
THOP1P52888 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
THOP1P52888 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
THOP1P52888 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
THOP1P52888 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
THOP1P52888 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
THOP1P52888 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
THOP1P52888 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
THOP1P52888 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
THOP1P52888 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
THOP1P52888 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
THOP1P52888 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
THOP1P52888 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
THOP1P52888 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
THOP1P52888 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
THOP1P52888 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
THOP1P52888 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
THOP1P52888 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
THOP1P52888 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
THOP1P52888 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
THOP1P52888 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
THOP1P52888 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms