Protein–RNA interactions for Protein: P29323

EPHB2, Ephrin type-B receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB2P29323 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPHB2P29323 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPHB2P29323 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPHB2P29323 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
EPHB2P29323 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPHB2P29323 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPHB2P29323 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPHB2P29323 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EPHB2P29323 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EPHB2P29323 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EPHB2P29323 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
EPHB2P29323 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EPHB2P29323 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EPHB2P29323 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EPHB2P29323 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EPHB2P29323 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EPHB2P29323 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EPHB2P29323 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EPHB2P29323 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EPHB2P29323 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EPHB2P29323 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EPHB2P29323 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EPHB2P29323 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPHB2P29323 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
EPHB2P29323 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPHB2P29323 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
EPHB2P29323 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPHB2P29323 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPHB2P29323 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EPHB2P29323 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EPHB2P29323 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EPHB2P29323 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EPHB2P29323 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EPHB2P29323 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
EPHB2P29323 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
EPHB2P29323 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EPHB2P29323 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EPHB2P29323 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EPHB2P29323 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPHB2P29323 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPHB2P29323 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPHB2P29323 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPHB2P29323 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPHB2P29323 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPHB2P29323 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPHB2P29323 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPHB2P29323 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EPHB2P29323 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EPHB2P29323 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EPHB2P29323 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EPHB2P29323 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EPHB2P29323 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EPHB2P29323 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EPHB2P29323 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EPHB2P29323 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPHB2P29323 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPHB2P29323 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPHB2P29323 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
EPHB2P29323 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPHB2P29323 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPHB2P29323 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
EPHB2P29323 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPHB2P29323 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPHB2P29323 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPHB2P29323 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPHB2P29323 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPHB2P29323 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPHB2P29323 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
EPHB2P29323 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPHB2P29323 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPHB2P29323 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPHB2P29323 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPHB2P29323 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPHB2P29323 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPHB2P29323 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPHB2P29323 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPHB2P29323 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPHB2P29323 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPHB2P29323 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPHB2P29323 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPHB2P29323 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPHB2P29323 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPHB2P29323 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPHB2P29323 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPHB2P29323 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPHB2P29323 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPHB2P29323 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPHB2P29323 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPHB2P29323 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
EPHB2P29323 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPHB2P29323 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPHB2P29323 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPHB2P29323 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPHB2P29323 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPHB2P29323 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPHB2P29323 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPHB2P29323 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPHB2P29323 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPHB2P29323 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPHB2P29323 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms