Protein–RNA interactions for Protein: P29323

EPHB2, Ephrin type-B receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB2P29323 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.24■■■■□ 3.23
EPHB2P29323 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
EPHB2P29323 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
EPHB2P29323 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
EPHB2P29323 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
EPHB2P29323 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
EPHB2P29323 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
EPHB2P29323 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
EPHB2P29323 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
EPHB2P29323 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
EPHB2P29323 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
EPHB2P29323 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
EPHB2P29323 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
EPHB2P29323 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
EPHB2P29323 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
EPHB2P29323 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
EPHB2P29323 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
EPHB2P29323 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
EPHB2P29323 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
EPHB2P29323 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
EPHB2P29323 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
EPHB2P29323 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
EPHB2P29323 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
EPHB2P29323 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
EPHB2P29323 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
EPHB2P29323 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
EPHB2P29323 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
EPHB2P29323 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
EPHB2P29323 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
EPHB2P29323 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
EPHB2P29323 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
EPHB2P29323 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
EPHB2P29323 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
EPHB2P29323 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
EPHB2P29323 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
EPHB2P29323 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
EPHB2P29323 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
EPHB2P29323 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
EPHB2P29323 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
EPHB2P29323 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
EPHB2P29323 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
EPHB2P29323 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
EPHB2P29323 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
EPHB2P29323 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
EPHB2P29323 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
EPHB2P29323 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
EPHB2P29323 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
EPHB2P29323 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
EPHB2P29323 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
EPHB2P29323 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
EPHB2P29323 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
EPHB2P29323 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
EPHB2P29323 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
EPHB2P29323 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
EPHB2P29323 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
EPHB2P29323 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
EPHB2P29323 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
EPHB2P29323 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
EPHB2P29323 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
EPHB2P29323 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
EPHB2P29323 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
EPHB2P29323 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
EPHB2P29323 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
EPHB2P29323 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
EPHB2P29323 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
EPHB2P29323 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
EPHB2P29323 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
EPHB2P29323 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
EPHB2P29323 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
EPHB2P29323 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
EPHB2P29323 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
EPHB2P29323 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
EPHB2P29323 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
EPHB2P29323 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
EPHB2P29323 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
EPHB2P29323 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
EPHB2P29323 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
EPHB2P29323 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
EPHB2P29323 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
EPHB2P29323 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
EPHB2P29323 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
EPHB2P29323 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
EPHB2P29323 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
EPHB2P29323 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
EPHB2P29323 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
EPHB2P29323 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
EPHB2P29323 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
EPHB2P29323 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
EPHB2P29323 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
EPHB2P29323 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
EPHB2P29323 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
EPHB2P29323 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
EPHB2P29323 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
EPHB2P29323 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
EPHB2P29323 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
EPHB2P29323 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
EPHB2P29323 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
EPHB2P29323 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
EPHB2P29323 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
EPHB2P29323 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms