Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
EPHA1P21709 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EPHA1P21709 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EPHA1P21709 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EPHA1P21709 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EPHA1P21709 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
EPHA1P21709 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EPHA1P21709 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EPHA1P21709 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EPHA1P21709 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EPHA1P21709 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EPHA1P21709 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EPHA1P21709 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EPHA1P21709 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EPHA1P21709 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
EPHA1P21709 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
EPHA1P21709 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EPHA1P21709 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EPHA1P21709 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EPHA1P21709 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EPHA1P21709 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EPHA1P21709 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EPHA1P21709 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EPHA1P21709 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EPHA1P21709 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EPHA1P21709 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EPHA1P21709 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EPHA1P21709 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EPHA1P21709 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EPHA1P21709 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EPHA1P21709 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EPHA1P21709 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EPHA1P21709 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EPHA1P21709 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EPHA1P21709 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EPHA1P21709 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EPHA1P21709 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EPHA1P21709 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EPHA1P21709 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EPHA1P21709 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EPHA1P21709 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EPHA1P21709 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EPHA1P21709 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EPHA1P21709 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
EPHA1P21709 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
EPHA1P21709 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EPHA1P21709 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EPHA1P21709 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EPHA1P21709 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EPHA1P21709 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EPHA1P21709 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EPHA1P21709 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EPHA1P21709 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EPHA1P21709 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EPHA1P21709 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EPHA1P21709 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EPHA1P21709 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EPHA1P21709 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EPHA1P21709 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EPHA1P21709 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
EPHA1P21709 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EPHA1P21709 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EPHA1P21709 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EPHA1P21709 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EPHA1P21709 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
EPHA1P21709 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
EPHA1P21709 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EPHA1P21709 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EPHA1P21709 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EPHA1P21709 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EPHA1P21709 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EPHA1P21709 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
EPHA1P21709 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20■□□□□ 0.79
EPHA1P21709 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EPHA1P21709 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EPHA1P21709 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
EPHA1P21709 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EPHA1P21709 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EPHA1P21709 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EPHA1P21709 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EPHA1P21709 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EPHA1P21709 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EPHA1P21709 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EPHA1P21709 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EPHA1P21709 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EPHA1P21709 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EPHA1P21709 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EPHA1P21709 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EPHA1P21709 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EPHA1P21709 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EPHA1P21709 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EPHA1P21709 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EPHA1P21709 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EPHA1P21709 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EPHA1P21709 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EPHA1P21709 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EPHA1P21709 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EPHA1P21709 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EPHA1P21709 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EPHA1P21709 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms