Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF35P13682 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF35P13682 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF35P13682 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF35P13682 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF35P13682 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF35P13682 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF35P13682 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF35P13682 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF35P13682 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF35P13682 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF35P13682 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF35P13682 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF35P13682 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF35P13682 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF35P13682 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF35P13682 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF35P13682 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF35P13682 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF35P13682 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF35P13682 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF35P13682 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF35P13682 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF35P13682 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF35P13682 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF35P13682 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF35P13682 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF35P13682 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF35P13682 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF35P13682 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF35P13682 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF35P13682 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF35P13682 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF35P13682 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF35P13682 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF35P13682 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF35P13682 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF35P13682 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF35P13682 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF35P13682 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF35P13682 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF35P13682 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF35P13682 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZNF35P13682 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZNF35P13682 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZNF35P13682 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF35P13682 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF35P13682 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF35P13682 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF35P13682 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF35P13682 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF35P13682 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF35P13682 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF35P13682 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF35P13682 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF35P13682 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF35P13682 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF35P13682 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF35P13682 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF35P13682 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF35P13682 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF35P13682 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF35P13682 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF35P13682 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF35P13682 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF35P13682 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF35P13682 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF35P13682 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF35P13682 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF35P13682 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF35P13682 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF35P13682 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF35P13682 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF35P13682 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF35P13682 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF35P13682 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF35P13682 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF35P13682 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF35P13682 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF35P13682 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF35P13682 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF35P13682 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF35P13682 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF35P13682 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF35P13682 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF35P13682 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF35P13682 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF35P13682 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF35P13682 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF35P13682 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF35P13682 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF35P13682 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF35P13682 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF35P13682 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF35P13682 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
ZNF35P13682 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZNF35P13682 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF35P13682 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF35P13682 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF35P13682 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms