Protein–RNA interactions for Protein: P0CG40

SP9, Transcription factor Sp9, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP9P0CG40 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SP9P0CG40 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SP9P0CG40 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SP9P0CG40 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SP9P0CG40 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SP9P0CG40 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SP9P0CG40 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SP9P0CG40 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SP9P0CG40 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SP9P0CG40 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SP9P0CG40 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SP9P0CG40 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SP9P0CG40 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SP9P0CG40 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SP9P0CG40 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SP9P0CG40 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SP9P0CG40 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SP9P0CG40 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SP9P0CG40 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SP9P0CG40 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SP9P0CG40 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SP9P0CG40 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SP9P0CG40 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SP9P0CG40 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SP9P0CG40 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SP9P0CG40 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SP9P0CG40 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SP9P0CG40 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SP9P0CG40 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SP9P0CG40 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SP9P0CG40 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SP9P0CG40 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SP9P0CG40 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SP9P0CG40 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SP9P0CG40 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SP9P0CG40 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SP9P0CG40 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SP9P0CG40 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SP9P0CG40 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SP9P0CG40 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SP9P0CG40 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SP9P0CG40 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SP9P0CG40 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SP9P0CG40 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SP9P0CG40 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SP9P0CG40 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SP9P0CG40 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SP9P0CG40 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SP9P0CG40 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SP9P0CG40 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SP9P0CG40 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SP9P0CG40 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SP9P0CG40 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SP9P0CG40 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SP9P0CG40 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SP9P0CG40 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SP9P0CG40 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SP9P0CG40 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SP9P0CG40 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SP9P0CG40 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SP9P0CG40 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SP9P0CG40 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SP9P0CG40 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SP9P0CG40 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SP9P0CG40 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SP9P0CG40 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SP9P0CG40 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SP9P0CG40 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SP9P0CG40 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SP9P0CG40 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SP9P0CG40 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SP9P0CG40 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SP9P0CG40 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SP9P0CG40 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SP9P0CG40 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SP9P0CG40 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SP9P0CG40 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SP9P0CG40 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SP9P0CG40 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SP9P0CG40 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SP9P0CG40 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SP9P0CG40 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SP9P0CG40 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SP9P0CG40 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SP9P0CG40 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SP9P0CG40 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SP9P0CG40 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SP9P0CG40 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SP9P0CG40 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SP9P0CG40 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SP9P0CG40 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SP9P0CG40 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SP9P0CG40 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SP9P0CG40 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SP9P0CG40 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SP9P0CG40 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SP9P0CG40 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SP9P0CG40 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SP9P0CG40 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SP9P0CG40 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms