Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PPC4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PPC4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A1W2PPC4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A1W2PPC4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A1W2PPC4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A1W2PPC4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A1W2PPC4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A1W2PPC4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A1W2PPC4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A1W2PPC4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A1W2PPC4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A1W2PPC4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A1W2PPC4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A1W2PPC4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A1W2PPC4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A1W2PPC4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A1W2PPC4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A1W2PPC4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A1W2PPC4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A1W2PPC4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A1W2PPC4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A1W2PPC4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A1W2PPC4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A1W2PPC4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A1W2PPC4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A1W2PPC4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A1W2PPC4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A1W2PPC4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A1W2PPC4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A1W2PPC4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A1W2PPC4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A1W2PPC4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A1W2PPC4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A1W2PPC4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A1W2PPC4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A1W2PPC4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A1W2PPC4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A1W2PPC4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A1W2PPC4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A1W2PPC4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A1W2PPC4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A1W2PPC4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A1W2PPC4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A1W2PPC4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A1W2PPC4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A1W2PPC4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A1W2PPC4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A1W2PPC4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A1W2PPC4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A1W2PPC4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A1W2PPC4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A1W2PPC4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A1W2PPC4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A1W2PPC4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A1W2PPC4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A1W2PPC4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A1W2PPC4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A1W2PPC4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A1W2PPC4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A1W2PPC4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A1W2PPC4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A1W2PPC4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A1W2PPC4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A1W2PPC4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A1W2PPC4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A1W2PPC4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A1W2PPC4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A1W2PPC4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A1W2PPC4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A1W2PPC4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A1W2PPC4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A1W2PPC4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A1W2PPC4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A1W2PPC4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A1W2PPC4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A1W2PPC4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A1W2PPC4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A1W2PPC4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A1W2PPC4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A1W2PPC4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A1W2PPC4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A1W2PPC4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A1W2PPC4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A1W2PPC4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A1W2PPC4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A1W2PPC4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A1W2PPC4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A1W2PPC4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A1W2PPC4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A1W2PPC4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A1W2PPC4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A1W2PPC4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A1W2PPC4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A1W2PPC4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A1W2PPC4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A1W2PPC4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A1W2PPC4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A1W2PPC4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A1W2PPC4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A1W2PPC4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A1W2PPC4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms