Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3R0

GRIP1, Glutamate receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIP1Q9Y3R0 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIP1Q9Y3R0 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIP1Q9Y3R0 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIP1Q9Y3R0 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIP1Q9Y3R0 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIP1Q9Y3R0 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GRIP1Q9Y3R0 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GRIP1Q9Y3R0 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GRIP1Q9Y3R0 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIP1Q9Y3R0 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms