Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms