Protein–RNA interactions for Protein: P08949

NMB, Neuromedin-B, humanhuman

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Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBP08949 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NMBP08949 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NMBP08949 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NMBP08949 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NMBP08949 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NMBP08949 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NMBP08949 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NMBP08949 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NMBP08949 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NMBP08949 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NMBP08949 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NMBP08949 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NMBP08949 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NMBP08949 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NMBP08949 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NMBP08949 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NMBP08949 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NMBP08949 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NMBP08949 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NMBP08949 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NMBP08949 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NMBP08949 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NMBP08949 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NMBP08949 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NMBP08949 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NMBP08949 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NMBP08949 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NMBP08949 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NMBP08949 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NMBP08949 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NMBP08949 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NMBP08949 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NMBP08949 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NMBP08949 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NMBP08949 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NMBP08949 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NMBP08949 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NMBP08949 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NMBP08949 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NMBP08949 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NMBP08949 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NMBP08949 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NMBP08949 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NMBP08949 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NMBP08949 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NMBP08949 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NMBP08949 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NMBP08949 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NMBP08949 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NMBP08949 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NMBP08949 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NMBP08949 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NMBP08949 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NMBP08949 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NMBP08949 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NMBP08949 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NMBP08949 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NMBP08949 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NMBP08949 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NMBP08949 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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NMBP08949 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NMBP08949 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NMBP08949 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NMBP08949 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NMBP08949 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NMBP08949 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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NMBP08949 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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NMBP08949 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NMBP08949 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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NMBP08949 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NMBP08949 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NMBP08949 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NMBP08949 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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NMBP08949 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NMBP08949 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NMBP08949 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NMBP08949 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NMBP08949 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NMBP08949 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NMBP08949 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NMBP08949 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NMBP08949 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NMBP08949 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NMBP08949 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NMBP08949 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NMBP08949 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NMBP08949 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NMBP08949 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NMBP08949 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NMBP08949 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NMBP08949 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NMBP08949 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NMBP08949 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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