RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000408919.7

SH3BP5-203, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP5, Length 1,880 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-203ENST00000408919 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.99■■■■■ 4.31
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SH3BP5-203ENST00000408919 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.15■■■■□ 3.22
SH3BP5-203ENST00000408919 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.81■■■■□ 3.16
SH3BP5-203ENST00000408919 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.71■■■■□ 3.15
SH3BP5-203ENST00000408919 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.54■■■■□ 3.12
SH3BP5-203ENST00000408919 NACADO15069 1562 aa34.54■■■■□ 3.12
SH3BP5-203ENST00000408919 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.4■■■■□ 3.1
SH3BP5-203ENST00000408919 SCRIBQ14160 1630 aa33.88■■■■□ 3.01
SH3BP5-203ENST00000408919 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.8■■■■□ 3
SH3BP5-203ENST00000408919 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.76■■■■□ 3
SH3BP5-203ENST00000408919 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.43■■■□□ 2.94
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SH3BP5-203ENST00000408919 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.7■■■□□ 2.83
SH3BP5-203ENST00000408919 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.47■■■□□ 2.79
SH3BP5-203ENST00000408919 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.45■■■□□ 2.78
SH3BP5-203ENST00000408919 SMARCA4P51532 1647 aa32.44■■■□□ 2.78
SH3BP5-203ENST00000408919 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.43■■■□□ 2.78
SH3BP5-203ENST00000408919 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.31■■■□□ 2.76
SH3BP5-203ENST00000408919 WIZO95785 1651 aa32.16■■■□□ 2.74
SH3BP5-203ENST00000408919 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.14■■■□□ 2.74
SH3BP5-203ENST00000408919 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.13■■■□□ 2.73
SH3BP5-203ENST00000408919 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.07■■■□□ 2.72
SH3BP5-203ENST00000408919 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.05■■■□□ 2.72
SH3BP5-203ENST00000408919 SMARCA2P51531 1590 aa32■■■□□ 2.71
SH3BP5-203ENST00000408919 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.93■■■□□ 2.7
SH3BP5-203ENST00000408919 NCAPD3P42695 1498 aa31.87■■■□□ 2.69
SH3BP5-203ENST00000408919 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.81■■■□□ 2.68
SH3BP5-203ENST00000408919 HMGXB3Q12766 1538 aa31.79■■■□□ 2.68
SH3BP5-203ENST00000408919 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.77■■■□□ 2.68
SH3BP5-203ENST00000408919 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.42■■■□□ 2.62
SH3BP5-203ENST00000408919 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.99■■■□□ 2.55
SH3BP5-203ENST00000408919 CFTRP13569 1480 aa30.99■■■□□ 2.55
SH3BP5-203ENST00000408919 NESP48681 1621 aa30.99■■■□□ 2.55
SH3BP5-203ENST00000408919 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.91■■■□□ 2.54
SH3BP5-203ENST00000408919 PRDM2Q13029 1718 aa30.88■■■□□ 2.53
SH3BP5-203ENST00000408919 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.67■■■□□ 2.5
SH3BP5-203ENST00000408919 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.65■■■□□ 2.5
SH3BP5-203ENST00000408919 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.64■■■□□ 2.5
SH3BP5-203ENST00000408919 ABCC8Q09428 1581 aa30.58■■■□□ 2.49
SH3BP5-203ENST00000408919 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.54■■■□□ 2.48
SH3BP5-203ENST00000408919 ERCC6Q03468 1493 aa30.47■■■□□ 2.47
SH3BP5-203ENST00000408919 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.42■■■□□ 2.46
SH3BP5-203ENST00000408919 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.42■■■□□ 2.46
SH3BP5-203ENST00000408919 CUX1P39880 1505 aa30.37■■■□□ 2.45
SH3BP5-203ENST00000408919 SYNJ1O43426 1573 aa30.37■■■□□ 2.45
SH3BP5-203ENST00000408919 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
SH3BP5-203ENST00000408919 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.32■■■□□ 2.44
SH3BP5-203ENST00000408919 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.31■■■□□ 2.44
SH3BP5-203ENST00000408919 TOP2BQ02880 1626 aa30.28■■■□□ 2.44
SH3BP5-203ENST00000408919 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.28■■■□□ 2.44
SH3BP5-203ENST00000408919 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.28■■■□□ 2.44
SH3BP5-203ENST00000408919 TOPBP1Q92547 1522 aa30.27■■■□□ 2.44
SH3BP5-203ENST00000408919 TRIM41Q8WV44 630 aa30.23■■■□□ 2.43
SH3BP5-203ENST00000408919 WDR62O43379 1518 aa30.21■■■□□ 2.43
SH3BP5-203ENST00000408919 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.12■■■□□ 2.41
SH3BP5-203ENST00000408919 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
SH3BP5-203ENST00000408919 CUX2O14529 1486 aa29.98■■■□□ 2.39
SH3BP5-203ENST00000408919 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.98■■■□□ 2.39
SH3BP5-203ENST00000408919 SOGA1O94964 1423 aa29.93■■■□□ 2.38
SH3BP5-203ENST00000408919 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
SH3BP5-203ENST00000408919 WDR97A6NE52 1622 aa29.87■■■□□ 2.37
SH3BP5-203ENST00000408919 IFT140Q96RY7 1462 aa29.83■■■□□ 2.37
SH3BP5-203ENST00000408919 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.83■■■□□ 2.37
SH3BP5-203ENST00000408919 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.8■■■□□ 2.36
SH3BP5-203ENST00000408919 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
SH3BP5-203ENST00000408919 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
SH3BP5-203ENST00000408919 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.69■■■□□ 2.34
SH3BP5-203ENST00000408919 KIF27Q86VH2 1401 aa29.68■■■□□ 2.34
SH3BP5-203ENST00000408919 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
SH3BP5-203ENST00000408919 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.65■■■□□ 2.343e-8■■■■■ 26.9
SH3BP5-203ENST00000408919 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.34
SH3BP5-203ENST00000408919 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.61■■■□□ 2.33
SH3BP5-203ENST00000408919 EEA1Q15075 1411 aa29.59■■■□□ 2.33
SH3BP5-203ENST00000408919 PBRM1Q86U86 1689 aa29.56■■■□□ 2.32
SH3BP5-203ENST00000408919 IGF1RP08069 1367 aa29.51■■■□□ 2.31
SH3BP5-203ENST00000408919 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.5■■■□□ 2.31
SH3BP5-203ENST00000408919 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.47■■■□□ 2.31
SH3BP5-203ENST00000408919 GRIN2BQ13224 1484 aa29.47■■■□□ 2.31
SH3BP5-203ENST00000408919 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.37■■■□□ 2.29
SH3BP5-203ENST00000408919 CUL7Q14999 1698 aa29.37■■■□□ 2.29
SH3BP5-203ENST00000408919 PRXQ9BXM0 1461 aa29.35■■■□□ 2.29
SH3BP5-203ENST00000408919 ADAMTS12P58397 1594 aa29.33■■■□□ 2.29
SH3BP5-203ENST00000408919 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.33■■■□□ 2.29
SH3BP5-203ENST00000408919 KIF21BO75037 1637 aa29.31■■■□□ 2.28
SH3BP5-203ENST00000408919 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.3■■■□□ 2.28
SH3BP5-203ENST00000408919 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.29■■■□□ 2.28
SH3BP5-203ENST00000408919 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.27■■■□□ 2.28
SH3BP5-203ENST00000408919 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.27■■■□□ 2.28
SH3BP5-203ENST00000408919 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.24■■■□□ 2.27
SH3BP5-203ENST00000408919 SYNJ2O15056 1496 aa29.2■■■□□ 2.26
SH3BP5-203ENST00000408919 GOLGA3Q08378 1498 aa29.18■■■□□ 2.26
SH3BP5-203ENST00000408919 CHD1O14646 1710 aa29.16■■■□□ 2.26
SH3BP5-203ENST00000408919 GRIN2AQ12879 1464 aa29.13■■■□□ 2.25
SH3BP5-203ENST00000408919 FBLN2P98095 1184 aa29.12■■■□□ 2.25
SH3BP5-203ENST00000408919 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
SH3BP5-203ENST00000408919 UBTFP17480 764 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
SH3BP5-203ENST00000408919 CEP170Q5SW79 1584 aa29■■■□□ 2.23
SH3BP5-203ENST00000408919 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29■■■□□ 2.23
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