Protein–RNA interactions for Protein: P08949

NMB, Neuromedin-B, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBP08949 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NMBP08949 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NMBP08949 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NMBP08949 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NMBP08949 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NMBP08949 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NMBP08949 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NMBP08949 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NMBP08949 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NMBP08949 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NMBP08949 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NMBP08949 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NMBP08949 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NMBP08949 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NMBP08949 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NMBP08949 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NMBP08949 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NMBP08949 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NMBP08949 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NMBP08949 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NMBP08949 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NMBP08949 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NMBP08949 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NMBP08949 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NMBP08949 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NMBP08949 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NMBP08949 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NMBP08949 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NMBP08949 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NMBP08949 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NMBP08949 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NMBP08949 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NMBP08949 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NMBP08949 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NMBP08949 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NMBP08949 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NMBP08949 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NMBP08949 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NMBP08949 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NMBP08949 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NMBP08949 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NMBP08949 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NMBP08949 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NMBP08949 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NMBP08949 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NMBP08949 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NMBP08949 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NMBP08949 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NMBP08949 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NMBP08949 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NMBP08949 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NMBP08949 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NMBP08949 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NMBP08949 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NMBP08949 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NMBP08949 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NMBP08949 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NMBP08949 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NMBP08949 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NMBP08949 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NMBP08949 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NMBP08949 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NMBP08949 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NMBP08949 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NMBP08949 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NMBP08949 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NMBP08949 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NMBP08949 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NMBP08949 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NMBP08949 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NMBP08949 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NMBP08949 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NMBP08949 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NMBP08949 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NMBP08949 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NMBP08949 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NMBP08949 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NMBP08949 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NMBP08949 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NMBP08949 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NMBP08949 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NMBP08949 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NMBP08949 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NMBP08949 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NMBP08949 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NMBP08949 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NMBP08949 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NMBP08949 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NMBP08949 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NMBP08949 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NMBP08949 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NMBP08949 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NMBP08949 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NMBP08949 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NMBP08949 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NMBP08949 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NMBP08949 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NMBP08949 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NMBP08949 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NMBP08949 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms