Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS0

RPS6KB2, Ribosomal protein S6 kinase beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB2Q9UBS0 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPS6KB2Q9UBS0 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms