Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.4 ms