Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms