Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms