Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 CHRD-208ENST00000460627 4719 ntTSL 218.14■□□□□ 0.492e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.252e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 CHRD-205ENST00000448472 3547 ntTSL 1 (best)16.62■□□□□ 0.252e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.012e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 CHRD-204ENST00000420973 3492 ntTSL 1 (best)14.5□□□□□ -0.092e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 CHRD-212ENST00000470150 4234 ntTSL 214.33□□□□□ -0.112e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 PSMA7-205ENST00000484488 1023 ntTSL 322.5■■□□□ 1.197e-8■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.287e-8■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.287e-8■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 PSMA7-202ENST00000370861 773 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.577e-8■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 SEPT2-210ENST00000420786 539 ntTSL 518.95■□□□□ 0.622e-8■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 CANX-218ENST00000514032 1876 ntTSL 221.18■□□□□ 0.985e-10■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.725e-10■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 PSMC5-215ENST00000583283 602 ntTSL 418.98■□□□□ 0.635e-10■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 ANKRD40-202ENST00000507114 567 ntTSL 216.38■□□□□ 0.215e-10■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.155e-10■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 SFXN2-202ENST00000459894 2324 ntTSL 215.23■□□□□ 0.035e-10■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.175e-10■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 SFXN2-203ENST00000480358 2315 ntTSL 513.74□□□□□ -0.215e-10■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 PSMC5-214ENST00000582420 394 ntTSL 413.44□□□□□ -0.265e-10■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 CANX-209ENST00000504734 2232 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.285e-10■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 SFXN2-201ENST00000369893 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.645e-10■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 CANX-205ENST00000502673 1000 ntTSL 510.85□□□□□ -0.675e-10■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 NOP56-208ENST00000467857 735 ntTSL 29.55□□□□□ -0.881e-8■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.99e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 USP36-205ENST00000586531 898 ntTSL 326.34■■□□□ 1.819e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 PHYKPL-211ENST00000494126 2297 ntTSL 1 (best)25.34■■□□□ 1.659e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 GSDMD-208ENST00000528475 2067 ntTSL 224.73■■□□□ 1.551e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.539e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 SPON2-204ENST00000502483 571 ntTSL 423.59■■□□□ 1.379e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 SPON2-207ENST00000504871 581 ntTSL 423.54■■□□□ 1.369e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.329e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 GSDMD-207ENST00000526469 1643 ntTSL 223.11■■□□□ 1.291e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.269e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.29e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 USP36-224ENST00000592907 543 ntTSL 222.51■■□□□ 1.199e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 PHYKPL-209ENST00000489262 2780 ntTSL 222.34■■□□□ 1.179e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 PHYKPL-204ENST00000474052 1539 ntTSL 1 (best)21.93■■□□□ 1.19e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 GSDMD-211ENST00000531184 2213 ntTSL 221.9■■□□□ 1.11e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 LINC-PINT-202ENST00000423414 616 ntTSL 421.61■■□□□ 1.059e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 GADD45A-203ENST00000460575 874 ntTSL 221.52■■□□□ 1.049e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 USP36-209ENST00000587783 679 ntTSL 321.25■□□□□ 0.999e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 SPON2-220ENST00000515004 571 ntTSL 421.23■□□□□ 0.999e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 SRCAP-203ENST00000411466 836 ntTSL 321.11■□□□□ 0.979e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 USP36-220ENST00000591942 564 ntTSL 520.63■□□□□ 0.899e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 GADD45A-204ENST00000484245 688 ntTSL 1 (best)20.45■□□□□ 0.869e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 LINC-PINT-204ENST00000431189 803 ntTSL 320.41■□□□□ 0.869e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.859e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.831e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 USP36-212ENST00000588365 546 ntTSL 420.04■□□□□ 0.89e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.729e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 PDPK1-215ENST00000566659 451 ntTSL 319.38■□□□□ 0.699e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.669e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.669e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.669e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.659e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.631e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 LINC-PINT-203ENST00000429901 565 ntTSL 418.72■□□□□ 0.599e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 REXO2-215ENST00000544010 848 ntTSL 218.68■□□□□ 0.589e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.569e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.559e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 REXO2-207ENST00000539333 651 ntTSL 218.5■□□□□ 0.559e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.551e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 SPON2-212ENST00000509233 549 ntTSL 418.28■□□□□ 0.529e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.529e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 LINC-PINT-205ENST00000433079 1262 ntTSL 1 (best)18■□□□□ 0.479e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 PHYKPL-210ENST00000493197 1969 ntTSL 217.93■□□□□ 0.469e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 PDPK1-212ENST00000491073 2387 ntTSL 1 (best)17.54■□□□□ 0.49e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 REXO2-214ENST00000543243 552 ntTSL 217.42■□□□□ 0.389e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 MAN2C1-204ENST00000561693 1152 ntTSL 517.3■□□□□ 0.369e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 COL6A1-206ENST00000498614 2358 ntTSL 1 (best)17.25■□□□□ 0.359e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 DBN1-206ENST00000472831 2667 ntTSL 217.22■□□□□ 0.359e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 REXO2-211ENST00000541703 475 ntTSL 317.19■□□□□ 0.349e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 REXO2-213ENST00000543131 539 ntTSL 317.19■□□□□ 0.349e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.319e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 REXO2-202ENST00000538198 449 ntTSL 316.81■□□□□ 0.289e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 POLR2C-204ENST00000563115 1062 ntTSL 216.8■□□□□ 0.289e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.279e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 EPB41-210ENST00000482464 675 ntTSL 216.68■□□□□ 0.269e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.259e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 DBN1-207ENST00000477391 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 316.34■□□□□ 0.219e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 SPON2-215ENST00000511672 557 ntTSL 416.28■□□□□ 0.29e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 GSDMD-202ENST00000524846 3462 ntTSL 216.07■□□□□ 0.161e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 COX19-202ENST00000457254 1420 ntTSL 216.01■□□□□ 0.159e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.19e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 GSDMD-215ENST00000534018 1101 ntTSL 515.69■□□□□ 0.11e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 SPON2-217ENST00000512150 505 ntTSL 415.38■□□□□ 0.059e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.059e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 GSDMD-205ENST00000526051 700 ntTSL 315.28■□□□□ 0.041e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 GAPVD1-210ENST00000461379 582 ntTSL 415.21■□□□□ 0.039e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.029e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 PDPK1-206ENST00000461815 611 ntTSL 314.95□□□□□ -0.029e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.069e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 REXO2-205ENST00000539119 664 ntTSL 314.69□□□□□ -0.069e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.069e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 SPON2-216ENST00000511679 556 ntTSL 514.62□□□□□ -0.079e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 SPON2-219ENST00000514490 307 ntTSL 414.62□□□□□ -0.079e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 MAN2C1-233ENST00000566569 848 ntTSL 514.49□□□□□ -0.099e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.19e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.129e-6■□□□□ 10.5
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