Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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ARL2-SNX15V9GYD0 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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ARL2-SNX15V9GYD0 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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ARL2-SNX15V9GYD0 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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ARL2-SNX15V9GYD0 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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ARL2-SNX15V9GYD0 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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ARL2-SNX15V9GYD0 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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ARL2-SNX15V9GYD0 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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