Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms