Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2D3

OTUD3, OTU domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD3Q5T2D3 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms