Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms