Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms