Protein–RNA interactions for Protein: Q04741

EMX1, Homeobox protein EMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX1Q04741 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EMX1Q04741 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EMX1Q04741 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EMX1Q04741 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EMX1Q04741 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EMX1Q04741 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMX1Q04741 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EMX1Q04741 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EMX1Q04741 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EMX1Q04741 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMX1Q04741 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMX1Q04741 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMX1Q04741 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EMX1Q04741 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMX1Q04741 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMX1Q04741 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMX1Q04741 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EMX1Q04741 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EMX1Q04741 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMX1Q04741 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMX1Q04741 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMX1Q04741 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMX1Q04741 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
EMX1Q04741 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EMX1Q04741 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMX1Q04741 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EMX1Q04741 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EMX1Q04741 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EMX1Q04741 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EMX1Q04741 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EMX1Q04741 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EMX1Q04741 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EMX1Q04741 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EMX1Q04741 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EMX1Q04741 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMX1Q04741 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EMX1Q04741 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMX1Q04741 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EMX1Q04741 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EMX1Q04741 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMX1Q04741 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMX1Q04741 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EMX1Q04741 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EMX1Q04741 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EMX1Q04741 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMX1Q04741 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMX1Q04741 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMX1Q04741 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMX1Q04741 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMX1Q04741 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EMX1Q04741 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EMX1Q04741 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMX1Q04741 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EMX1Q04741 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMX1Q04741 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EMX1Q04741 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EMX1Q04741 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EMX1Q04741 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EMX1Q04741 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EMX1Q04741 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EMX1Q04741 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EMX1Q04741 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EMX1Q04741 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EMX1Q04741 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EMX1Q04741 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EMX1Q04741 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EMX1Q04741 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EMX1Q04741 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EMX1Q04741 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
EMX1Q04741 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EMX1Q04741 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EMX1Q04741 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EMX1Q04741 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EMX1Q04741 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EMX1Q04741 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
EMX1Q04741 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
EMX1Q04741 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EMX1Q04741 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EMX1Q04741 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EMX1Q04741 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
EMX1Q04741 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EMX1Q04741 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EMX1Q04741 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EMX1Q04741 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EMX1Q04741 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EMX1Q04741 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EMX1Q04741 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EMX1Q04741 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EMX1Q04741 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EMX1Q04741 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EMX1Q04741 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EMX1Q04741 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EMX1Q04741 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EMX1Q04741 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EMX1Q04741 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EMX1Q04741 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EMX1Q04741 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EMX1Q04741 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EMX1Q04741 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EMX1Q04741 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms