Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms