Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMBRP28336 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMBRP28336 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMBRP28336 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMBRP28336 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMBRP28336 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMBRP28336 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMBRP28336 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMBRP28336 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMBRP28336 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMBRP28336 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMBRP28336 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMBRP28336 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMBRP28336 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMBRP28336 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMBRP28336 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMBRP28336 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMBRP28336 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMBRP28336 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMBRP28336 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMBRP28336 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMBRP28336 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMBRP28336 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMBRP28336 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMBRP28336 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMBRP28336 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMBRP28336 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMBRP28336 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMBRP28336 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMBRP28336 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMBRP28336 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMBRP28336 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMBRP28336 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMBRP28336 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMBRP28336 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMBRP28336 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMBRP28336 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMBRP28336 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMBRP28336 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMBRP28336 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMBRP28336 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMBRP28336 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMBRP28336 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMBRP28336 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMBRP28336 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMBRP28336 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMBRP28336 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMBRP28336 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMBRP28336 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMBRP28336 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMBRP28336 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMBRP28336 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMBRP28336 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMBRP28336 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMBRP28336 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMBRP28336 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMBRP28336 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMBRP28336 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMBRP28336 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMBRP28336 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMBRP28336 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMBRP28336 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMBRP28336 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMBRP28336 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMBRP28336 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NMBRP28336 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMBRP28336 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMBRP28336 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NMBRP28336 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMBRP28336 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NMBRP28336 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMBRP28336 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMBRP28336 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMBRP28336 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NMBRP28336 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMBRP28336 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMBRP28336 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMBRP28336 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMBRP28336 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMBRP28336 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMBRP28336 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMBRP28336 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMBRP28336 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMBRP28336 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMBRP28336 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMBRP28336 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMBRP28336 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMBRP28336 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMBRP28336 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMBRP28336 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMBRP28336 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMBRP28336 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMBRP28336 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMBRP28336 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMBRP28336 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMBRP28336 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMBRP28336 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMBRP28336 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMBRP28336 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMBRP28336 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms