Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms