Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.46■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms