Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms