Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF3P78545 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF3P78545 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF3P78545 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF3P78545 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF3P78545 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF3P78545 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF3P78545 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF3P78545 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF3P78545 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF3P78545 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF3P78545 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF3P78545 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF3P78545 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF3P78545 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF3P78545 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF3P78545 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF3P78545 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF3P78545 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF3P78545 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF3P78545 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF3P78545 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF3P78545 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF3P78545 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF3P78545 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF3P78545 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF3P78545 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF3P78545 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF3P78545 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF3P78545 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF3P78545 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF3P78545 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF3P78545 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF3P78545 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF3P78545 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF3P78545 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF3P78545 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELF3P78545 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELF3P78545 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELF3P78545 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELF3P78545 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELF3P78545 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELF3P78545 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELF3P78545 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELF3P78545 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELF3P78545 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELF3P78545 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELF3P78545 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELF3P78545 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELF3P78545 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELF3P78545 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELF3P78545 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELF3P78545 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELF3P78545 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELF3P78545 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELF3P78545 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ELF3P78545 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELF3P78545 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELF3P78545 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELF3P78545 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELF3P78545 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELF3P78545 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELF3P78545 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ELF3P78545 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELF3P78545 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELF3P78545 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELF3P78545 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELF3P78545 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELF3P78545 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELF3P78545 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELF3P78545 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELF3P78545 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELF3P78545 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELF3P78545 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELF3P78545 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ELF3P78545 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELF3P78545 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELF3P78545 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELF3P78545 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELF3P78545 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELF3P78545 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ELF3P78545 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELF3P78545 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELF3P78545 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELF3P78545 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELF3P78545 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELF3P78545 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELF3P78545 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELF3P78545 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELF3P78545 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELF3P78545 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELF3P78545 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELF3P78545 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELF3P78545 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELF3P78545 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELF3P78545 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELF3P78545 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELF3P78545 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELF3P78545 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELF3P78545 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms