RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300213.8

CCNDBP1-201, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCNDBP1, Length 3,660 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-201ENST00000300213 NISCHQ9Y2I1 1504 aa26.21■■□□□ 1.79
CCNDBP1-201ENST00000300213 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
CCNDBP1-201ENST00000300213 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.71■■□□□ 1.55
CCNDBP1-201ENST00000300213 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.66■■□□□ 1.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 HRCP23327 699 aa24.64■■□□□ 1.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
CCNDBP1-201ENST00000300213 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.75■■□□□ 1.39
CCNDBP1-201ENST00000300213 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23.74■■□□□ 1.39
CCNDBP1-201ENST00000300213 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.68■■□□□ 1.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.6■■□□□ 1.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.52■■□□□ 1.36
CCNDBP1-201ENST00000300213 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
CCNDBP1-201ENST00000300213 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
CCNDBP1-201ENST00000300213 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
CCNDBP1-201ENST00000300213 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23■■□□□ 1.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 NEUROD1Q13562 356 aa22.95■■□□□ 1.26
CCNDBP1-201ENST00000300213 MYT1Q01538 1121 aa22.9■■□□□ 1.26
CCNDBP1-201ENST00000300213 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa22.83■■□□□ 1.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
CCNDBP1-201ENST00000300213 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
CCNDBP1-201ENST00000300213 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
CCNDBP1-201ENST00000300213 TRIM41Q8WV44 630 aa22.64■■□□□ 1.22
CCNDBP1-201ENST00000300213 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa22.43■■□□□ 1.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CCNDBP1-201ENST00000300213 MIER1Q8N108 512 aa22.02■■□□□ 1.12
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
CCNDBP1-201ENST00000300213 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 BCANQ96GW7 911 aa21.83■■□□□ 1.08
CCNDBP1-201ENST00000300213 BCL11AQ9H165 835 aa21.78■■□□□ 1.08
CCNDBP1-201ENST00000300213 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
CCNDBP1-201ENST00000300213 UBTFP17480 764 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
CCNDBP1-201ENST00000300213 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.64■■□□□ 1.05
CCNDBP1-201ENST00000300213 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
CCNDBP1-201ENST00000300213 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.56■■□□□ 1.04
CCNDBP1-201ENST00000300213 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.51■■□□□ 1.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 APLP2Q06481 763 aa21.47■■□□□ 1.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
CCNDBP1-201ENST00000300213 ERICH6Q7L0X2 663 aa21.36■■□□□ 1.01
CCNDBP1-201ENST00000300213 FKBP8Q14318 412 aa21.36■■□□□ 1.01
CCNDBP1-201ENST00000300213 ITGAEP38570 1179 aa21.34■■□□□ 1.01
CCNDBP1-201ENST00000300213 NEFLP07196 543 aa21.3■■□□□ 1
CCNDBP1-201ENST00000300213 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa21.28■■□□□ 1
CCNDBP1-201ENST00000300213 KCNH8Q96L42 1107 aa21.22■□□□□ 0.99
CCNDBP1-201ENST00000300213 CEP162Q5TB80 1403 aa21.16■□□□□ 0.98
CCNDBP1-201ENST00000300213 TRIM52Q96A61 297 aa21.11■□□□□ 0.97
CCNDBP1-201ENST00000300213 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
CCNDBP1-201ENST00000300213 SCRIBQ14160 1630 aa21.1■□□□□ 0.97
CCNDBP1-201ENST00000300213 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.09■□□□□ 0.97
CCNDBP1-201ENST00000300213 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
CCNDBP1-201ENST00000300213 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
CCNDBP1-201ENST00000300213 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
CCNDBP1-201ENST00000300213 ABCC9O60706 1549 aa21■□□□□ 0.95
CCNDBP1-201ENST00000300213 SOGA1O94964 1423 aa20.93■□□□□ 0.94
CCNDBP1-201ENST00000300213 CECR2Q9BXF3 1484 aa20.89■□□□□ 0.94
CCNDBP1-201ENST00000300213 NBR1Q14596 966 aa20.85■□□□□ 0.93
CCNDBP1-201ENST00000300213 CCDC88BA6NC98 1476 aa20.84■□□□□ 0.93
CCNDBP1-201ENST00000300213 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
CCNDBP1-201ENST00000300213 TNIKQ9UKE5 1360 aa20.83■□□□□ 0.93
CCNDBP1-201ENST00000300213 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.8■□□□□ 0.92
CCNDBP1-201ENST00000300213 ABCC8Q09428 1581 aa20.8■□□□□ 0.92
CCNDBP1-201ENST00000300213 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
CCNDBP1-201ENST00000300213 MSH5O43196 834 aa20.77■□□□□ 0.92
CCNDBP1-201ENST00000300213 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.74■□□□□ 0.91
CCNDBP1-201ENST00000300213 ANP32CO43423 234 aa20.72■□□□□ 0.91
CCNDBP1-201ENST00000300213 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
CCNDBP1-201ENST00000300213 DEKP35659 375 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
CCNDBP1-201ENST00000300213 MROH2BQ7Z745 1585 aa20.69■□□□□ 0.9
CCNDBP1-201ENST00000300213 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
CCNDBP1-201ENST00000300213 CLIP1P30622 1438 aa20.67■□□□□ 0.9
CCNDBP1-201ENST00000300213 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP20.66■□□□□ 0.9
CCNDBP1-201ENST00000300213 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
CCNDBP1-201ENST00000300213 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP20.63■□□□□ 0.89
CCNDBP1-201ENST00000300213 SIN3AQ96ST3 1273 aa20.62■□□□□ 0.89
CCNDBP1-201ENST00000300213 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
CCNDBP1-201ENST00000300213 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
CCNDBP1-201ENST00000300213 WIZO95785 1651 aa20.58■□□□□ 0.88
CCNDBP1-201ENST00000300213 GOLGA3Q08378 1498 aa20.57■□□□□ 0.88
CCNDBP1-201ENST00000300213 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
CCNDBP1-201ENST00000300213 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
CCNDBP1-201ENST00000300213 CCDC136Q96JN2 1154 aa20.55■□□□□ 0.88
CCNDBP1-201ENST00000300213 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
CCNDBP1-201ENST00000300213 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa20.5■□□□□ 0.87
CCNDBP1-201ENST00000300213 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa20.5■□□□□ 0.87
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
CCNDBP1-201ENST00000300213 VPS8Q8N3P4 1428 aa20.41■□□□□ 0.86
CCNDBP1-201ENST00000300213 FAM9BQ8IZU0 186 aa20.41■□□□□ 0.86
CCNDBP1-201ENST00000300213 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
CCNDBP1-201ENST00000300213 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
CCNDBP1-201ENST00000300213 FANCIQ9NVI1 1328 aa20.36■□□□□ 0.85
CCNDBP1-201ENST00000300213 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CCNDBP1-201ENST00000300213 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
CCNDBP1-201ENST00000300213 EEA1Q15075 1411 aa20.34■□□□□ 0.85
CCNDBP1-201ENST00000300213 POLR3GLQ9BT43 218 aa20.32■□□□□ 0.84
CCNDBP1-201ENST00000300213 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
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