Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TPTEP56180 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TPTEP56180 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TPTEP56180 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TPTEP56180 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TPTEP56180 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TPTEP56180 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TPTEP56180 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TPTEP56180 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TPTEP56180 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TPTEP56180 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TPTEP56180 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TPTEP56180 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TPTEP56180 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TPTEP56180 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TPTEP56180 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TPTEP56180 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TPTEP56180 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TPTEP56180 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TPTEP56180 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TPTEP56180 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TPTEP56180 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TPTEP56180 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TPTEP56180 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TPTEP56180 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TPTEP56180 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TPTEP56180 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TPTEP56180 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TPTEP56180 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TPTEP56180 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TPTEP56180 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TPTEP56180 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TPTEP56180 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TPTEP56180 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TPTEP56180 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TPTEP56180 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TPTEP56180 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TPTEP56180 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TPTEP56180 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TPTEP56180 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TPTEP56180 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TPTEP56180 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TPTEP56180 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TPTEP56180 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TPTEP56180 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TPTEP56180 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TPTEP56180 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TPTEP56180 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TPTEP56180 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TPTEP56180 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TPTEP56180 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TPTEP56180 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TPTEP56180 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TPTEP56180 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TPTEP56180 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TPTEP56180 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TPTEP56180 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TPTEP56180 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TPTEP56180 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TPTEP56180 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TPTEP56180 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TPTEP56180 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TPTEP56180 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TPTEP56180 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TPTEP56180 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TPTEP56180 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TPTEP56180 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TPTEP56180 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TPTEP56180 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TPTEP56180 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TPTEP56180 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TPTEP56180 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TPTEP56180 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TPTEP56180 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TPTEP56180 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TPTEP56180 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TPTEP56180 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TPTEP56180 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TPTEP56180 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TPTEP56180 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TPTEP56180 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TPTEP56180 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TPTEP56180 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TPTEP56180 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TPTEP56180 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TPTEP56180 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TPTEP56180 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TPTEP56180 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TPTEP56180 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TPTEP56180 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TPTEP56180 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TPTEP56180 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TPTEP56180 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TPTEP56180 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TPTEP56180 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TPTEP56180 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TPTEP56180 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TPTEP56180 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TPTEP56180 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TPTEP56180 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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