Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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