Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X8

UBE2D4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D4, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D4Q9Y2X8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2D4Q9Y2X8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2D4Q9Y2X8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2D4Q9Y2X8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2D4Q9Y2X8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2D4Q9Y2X8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2D4Q9Y2X8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2D4Q9Y2X8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2D4Q9Y2X8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2D4Q9Y2X8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2D4Q9Y2X8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2D4Q9Y2X8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2D4Q9Y2X8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2D4Q9Y2X8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2D4Q9Y2X8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2D4Q9Y2X8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2D4Q9Y2X8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2D4Q9Y2X8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2D4Q9Y2X8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2D4Q9Y2X8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2D4Q9Y2X8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2D4Q9Y2X8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2D4Q9Y2X8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2D4Q9Y2X8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2D4Q9Y2X8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2D4Q9Y2X8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2D4Q9Y2X8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2D4Q9Y2X8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2D4Q9Y2X8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2D4Q9Y2X8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2D4Q9Y2X8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2D4Q9Y2X8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2D4Q9Y2X8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2D4Q9Y2X8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2D4Q9Y2X8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2D4Q9Y2X8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2D4Q9Y2X8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2D4Q9Y2X8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2D4Q9Y2X8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2D4Q9Y2X8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2D4Q9Y2X8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2D4Q9Y2X8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2D4Q9Y2X8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2D4Q9Y2X8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2D4Q9Y2X8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2D4Q9Y2X8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2D4Q9Y2X8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2D4Q9Y2X8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2D4Q9Y2X8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms