Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
SCN11AQ9UI33 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SCN11AQ9UI33 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SCN11AQ9UI33 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SCN11AQ9UI33 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SCN11AQ9UI33 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SCN11AQ9UI33 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SCN11AQ9UI33 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SCN11AQ9UI33 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SCN11AQ9UI33 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SCN11AQ9UI33 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SCN11AQ9UI33 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SCN11AQ9UI33 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SCN11AQ9UI33 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SCN11AQ9UI33 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
SCN11AQ9UI33 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
SCN11AQ9UI33 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SCN11AQ9UI33 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SCN11AQ9UI33 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
SCN11AQ9UI33 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
SCN11AQ9UI33 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SCN11AQ9UI33 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
SCN11AQ9UI33 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SCN11AQ9UI33 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
SCN11AQ9UI33 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
SCN11AQ9UI33 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
SCN11AQ9UI33 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SCN11AQ9UI33 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SCN11AQ9UI33 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SCN11AQ9UI33 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SCN11AQ9UI33 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SCN11AQ9UI33 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SCN11AQ9UI33 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
SCN11AQ9UI33 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
SCN11AQ9UI33 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
SCN11AQ9UI33 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SCN11AQ9UI33 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SCN11AQ9UI33 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
SCN11AQ9UI33 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SCN11AQ9UI33 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SCN11AQ9UI33 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SCN11AQ9UI33 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SCN11AQ9UI33 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SCN11AQ9UI33 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SCN11AQ9UI33 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SCN11AQ9UI33 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SCN11AQ9UI33 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
SCN11AQ9UI33 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SCN11AQ9UI33 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SCN11AQ9UI33 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SCN11AQ9UI33 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SCN11AQ9UI33 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SCN11AQ9UI33 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SCN11AQ9UI33 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SCN11AQ9UI33 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
SCN11AQ9UI33 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SCN11AQ9UI33 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SCN11AQ9UI33 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SCN11AQ9UI33 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SCN11AQ9UI33 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
SCN11AQ9UI33 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
SCN11AQ9UI33 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SCN11AQ9UI33 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
SCN11AQ9UI33 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
SCN11AQ9UI33 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SCN11AQ9UI33 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SCN11AQ9UI33 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SCN11AQ9UI33 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SCN11AQ9UI33 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
SCN11AQ9UI33 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SCN11AQ9UI33 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SCN11AQ9UI33 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SCN11AQ9UI33 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SCN11AQ9UI33 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SCN11AQ9UI33 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SCN11AQ9UI33 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SCN11AQ9UI33 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
SCN11AQ9UI33 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
SCN11AQ9UI33 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
SCN11AQ9UI33 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SCN11AQ9UI33 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SCN11AQ9UI33 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SCN11AQ9UI33 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SCN11AQ9UI33 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SCN11AQ9UI33 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SCN11AQ9UI33 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
SCN11AQ9UI33 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SCN11AQ9UI33 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
SCN11AQ9UI33 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
SCN11AQ9UI33 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
SCN11AQ9UI33 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
SCN11AQ9UI33 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SCN11AQ9UI33 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
SCN11AQ9UI33 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SCN11AQ9UI33 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
SCN11AQ9UI33 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SCN11AQ9UI33 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SCN11AQ9UI33 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SCN11AQ9UI33 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SCN11AQ9UI33 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms