Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC88CQ9P219 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC88CQ9P219 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC88CQ9P219 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC88CQ9P219 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC88CQ9P219 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC88CQ9P219 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC88CQ9P219 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC88CQ9P219 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC88CQ9P219 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC88CQ9P219 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC88CQ9P219 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC88CQ9P219 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC88CQ9P219 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC88CQ9P219 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC88CQ9P219 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC88CQ9P219 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC88CQ9P219 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC88CQ9P219 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC88CQ9P219 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC88CQ9P219 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC88CQ9P219 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC88CQ9P219 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC88CQ9P219 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC88CQ9P219 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC88CQ9P219 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC88CQ9P219 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC88CQ9P219 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC88CQ9P219 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC88CQ9P219 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC88CQ9P219 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC88CQ9P219 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC88CQ9P219 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC88CQ9P219 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC88CQ9P219 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC88CQ9P219 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC88CQ9P219 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC88CQ9P219 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC88CQ9P219 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC88CQ9P219 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC88CQ9P219 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC88CQ9P219 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC88CQ9P219 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC88CQ9P219 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC88CQ9P219 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC88CQ9P219 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC88CQ9P219 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC88CQ9P219 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC88CQ9P219 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC88CQ9P219 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC88CQ9P219 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC88CQ9P219 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC88CQ9P219 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC88CQ9P219 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC88CQ9P219 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC88CQ9P219 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC88CQ9P219 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC88CQ9P219 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC88CQ9P219 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC88CQ9P219 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC88CQ9P219 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC88CQ9P219 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC88CQ9P219 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC88CQ9P219 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC88CQ9P219 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC88CQ9P219 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC88CQ9P219 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC88CQ9P219 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC88CQ9P219 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC88CQ9P219 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC88CQ9P219 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC88CQ9P219 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC88CQ9P219 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC88CQ9P219 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC88CQ9P219 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC88CQ9P219 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC88CQ9P219 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC88CQ9P219 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC88CQ9P219 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC88CQ9P219 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC88CQ9P219 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC88CQ9P219 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC88CQ9P219 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC88CQ9P219 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC88CQ9P219 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC88CQ9P219 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC88CQ9P219 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC88CQ9P219 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC88CQ9P219 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC88CQ9P219 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC88CQ9P219 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC88CQ9P219 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC88CQ9P219 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC88CQ9P219 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC88CQ9P219 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC88CQ9P219 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC88CQ9P219 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC88CQ9P219 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC88CQ9P219 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC88CQ9P219 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms