Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS3

NECTIN3, Nectin-3, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN3Q9NQS3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NECTIN3Q9NQS3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NECTIN3Q9NQS3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NECTIN3Q9NQS3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NECTIN3Q9NQS3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECTIN3Q9NQS3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECTIN3Q9NQS3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECTIN3Q9NQS3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECTIN3Q9NQS3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECTIN3Q9NQS3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECTIN3Q9NQS3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECTIN3Q9NQS3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECTIN3Q9NQS3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NECTIN3Q9NQS3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NECTIN3Q9NQS3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NECTIN3Q9NQS3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NECTIN3Q9NQS3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NECTIN3Q9NQS3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NECTIN3Q9NQS3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NECTIN3Q9NQS3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NECTIN3Q9NQS3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NECTIN3Q9NQS3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NECTIN3Q9NQS3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NECTIN3Q9NQS3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NECTIN3Q9NQS3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NECTIN3Q9NQS3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NECTIN3Q9NQS3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NECTIN3Q9NQS3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NECTIN3Q9NQS3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NECTIN3Q9NQS3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NECTIN3Q9NQS3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NECTIN3Q9NQS3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NECTIN3Q9NQS3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NECTIN3Q9NQS3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NECTIN3Q9NQS3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NECTIN3Q9NQS3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NECTIN3Q9NQS3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NECTIN3Q9NQS3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NECTIN3Q9NQS3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NECTIN3Q9NQS3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NECTIN3Q9NQS3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NECTIN3Q9NQS3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NECTIN3Q9NQS3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NECTIN3Q9NQS3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NECTIN3Q9NQS3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NECTIN3Q9NQS3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NECTIN3Q9NQS3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NECTIN3Q9NQS3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NECTIN3Q9NQS3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NECTIN3Q9NQS3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NECTIN3Q9NQS3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NECTIN3Q9NQS3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NECTIN3Q9NQS3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NECTIN3Q9NQS3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NECTIN3Q9NQS3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NECTIN3Q9NQS3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NECTIN3Q9NQS3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NECTIN3Q9NQS3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NECTIN3Q9NQS3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NECTIN3Q9NQS3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NECTIN3Q9NQS3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NECTIN3Q9NQS3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NECTIN3Q9NQS3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NECTIN3Q9NQS3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NECTIN3Q9NQS3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NECTIN3Q9NQS3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NECTIN3Q9NQS3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NECTIN3Q9NQS3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NECTIN3Q9NQS3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NECTIN3Q9NQS3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NECTIN3Q9NQS3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NECTIN3Q9NQS3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NECTIN3Q9NQS3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NECTIN3Q9NQS3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NECTIN3Q9NQS3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NECTIN3Q9NQS3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NECTIN3Q9NQS3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NECTIN3Q9NQS3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NECTIN3Q9NQS3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NECTIN3Q9NQS3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NECTIN3Q9NQS3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NECTIN3Q9NQS3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NECTIN3Q9NQS3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NECTIN3Q9NQS3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NECTIN3Q9NQS3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NECTIN3Q9NQS3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NECTIN3Q9NQS3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NECTIN3Q9NQS3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NECTIN3Q9NQS3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NECTIN3Q9NQS3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NECTIN3Q9NQS3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NECTIN3Q9NQS3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NECTIN3Q9NQS3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NECTIN3Q9NQS3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NECTIN3Q9NQS3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NECTIN3Q9NQS3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NECTIN3Q9NQS3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NECTIN3Q9NQS3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NECTIN3Q9NQS3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NECTIN3Q9NQS3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms