Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP99

TREM1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREM1Q9NP99 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TREM1Q9NP99 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TREM1Q9NP99 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TREM1Q9NP99 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TREM1Q9NP99 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TREM1Q9NP99 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TREM1Q9NP99 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TREM1Q9NP99 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TREM1Q9NP99 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TREM1Q9NP99 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TREM1Q9NP99 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TREM1Q9NP99 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TREM1Q9NP99 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TREM1Q9NP99 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TREM1Q9NP99 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TREM1Q9NP99 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TREM1Q9NP99 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TREM1Q9NP99 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TREM1Q9NP99 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TREM1Q9NP99 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TREM1Q9NP99 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TREM1Q9NP99 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TREM1Q9NP99 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TREM1Q9NP99 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TREM1Q9NP99 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TREM1Q9NP99 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TREM1Q9NP99 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TREM1Q9NP99 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TREM1Q9NP99 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TREM1Q9NP99 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TREM1Q9NP99 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TREM1Q9NP99 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TREM1Q9NP99 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TREM1Q9NP99 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TREM1Q9NP99 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TREM1Q9NP99 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TREM1Q9NP99 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TREM1Q9NP99 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TREM1Q9NP99 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TREM1Q9NP99 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TREM1Q9NP99 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TREM1Q9NP99 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TREM1Q9NP99 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TREM1Q9NP99 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TREM1Q9NP99 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TREM1Q9NP99 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TREM1Q9NP99 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TREM1Q9NP99 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TREM1Q9NP99 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TREM1Q9NP99 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TREM1Q9NP99 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TREM1Q9NP99 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TREM1Q9NP99 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TREM1Q9NP99 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TREM1Q9NP99 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TREM1Q9NP99 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TREM1Q9NP99 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TREM1Q9NP99 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TREM1Q9NP99 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TREM1Q9NP99 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TREM1Q9NP99 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TREM1Q9NP99 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TREM1Q9NP99 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TREM1Q9NP99 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TREM1Q9NP99 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TREM1Q9NP99 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TREM1Q9NP99 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TREM1Q9NP99 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TREM1Q9NP99 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TREM1Q9NP99 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TREM1Q9NP99 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TREM1Q9NP99 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TREM1Q9NP99 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TREM1Q9NP99 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TREM1Q9NP99 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TREM1Q9NP99 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TREM1Q9NP99 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TREM1Q9NP99 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TREM1Q9NP99 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TREM1Q9NP99 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TREM1Q9NP99 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TREM1Q9NP99 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TREM1Q9NP99 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TREM1Q9NP99 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TREM1Q9NP99 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TREM1Q9NP99 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TREM1Q9NP99 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TREM1Q9NP99 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TREM1Q9NP99 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TREM1Q9NP99 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TREM1Q9NP99 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TREM1Q9NP99 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TREM1Q9NP99 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TREM1Q9NP99 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TREM1Q9NP99 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TREM1Q9NP99 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TREM1Q9NP99 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TREM1Q9NP99 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TREM1Q9NP99 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TREM1Q9NP99 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms