Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM63Q969Q1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM63Q969Q1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM63Q969Q1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM63Q969Q1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM63Q969Q1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM63Q969Q1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM63Q969Q1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM63Q969Q1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM63Q969Q1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM63Q969Q1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM63Q969Q1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM63Q969Q1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM63Q969Q1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM63Q969Q1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM63Q969Q1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRIM63Q969Q1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM63Q969Q1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM63Q969Q1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM63Q969Q1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM63Q969Q1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM63Q969Q1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM63Q969Q1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM63Q969Q1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM63Q969Q1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM63Q969Q1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM63Q969Q1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM63Q969Q1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM63Q969Q1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM63Q969Q1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM63Q969Q1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM63Q969Q1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM63Q969Q1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM63Q969Q1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM63Q969Q1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM63Q969Q1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIM63Q969Q1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIM63Q969Q1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIM63Q969Q1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIM63Q969Q1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIM63Q969Q1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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TRIM63Q969Q1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIM63Q969Q1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIM63Q969Q1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIM63Q969Q1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIM63Q969Q1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIM63Q969Q1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIM63Q969Q1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIM63Q969Q1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIM63Q969Q1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIM63Q969Q1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIM63Q969Q1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIM63Q969Q1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIM63Q969Q1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIM63Q969Q1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIM63Q969Q1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
TRIM63Q969Q1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM63Q969Q1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM63Q969Q1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM63Q969Q1 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM63Q969Q1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM63Q969Q1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM63Q969Q1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM63Q969Q1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM63Q969Q1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM63Q969Q1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIM63Q969Q1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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TRIM63Q969Q1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIM63Q969Q1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIM63Q969Q1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIM63Q969Q1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIM63Q969Q1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIM63Q969Q1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM63Q969Q1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM63Q969Q1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM63Q969Q1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM63Q969Q1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM63Q969Q1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM63Q969Q1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM63Q969Q1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM63Q969Q1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM63Q969Q1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM63Q969Q1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM63Q969Q1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM63Q969Q1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM63Q969Q1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM63Q969Q1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM63Q969Q1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRIM63Q969Q1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRIM63Q969Q1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRIM63Q969Q1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRIM63Q969Q1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRIM63Q969Q1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRIM63Q969Q1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRIM63Q969Q1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRIM63Q969Q1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRIM63Q969Q1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TRIM63Q969Q1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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