Protein–RNA interactions for Protein: Q92932

PTPRN2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2Q92932 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRN2Q92932 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRN2Q92932 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRN2Q92932 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRN2Q92932 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRN2Q92932 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRN2Q92932 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRN2Q92932 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRN2Q92932 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRN2Q92932 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRN2Q92932 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRN2Q92932 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRN2Q92932 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRN2Q92932 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRN2Q92932 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRN2Q92932 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRN2Q92932 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRN2Q92932 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRN2Q92932 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRN2Q92932 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRN2Q92932 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRN2Q92932 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRN2Q92932 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRN2Q92932 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRN2Q92932 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRN2Q92932 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRN2Q92932 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRN2Q92932 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRN2Q92932 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRN2Q92932 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRN2Q92932 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRN2Q92932 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRN2Q92932 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRN2Q92932 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRN2Q92932 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRN2Q92932 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRN2Q92932 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRN2Q92932 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRN2Q92932 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRN2Q92932 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRN2Q92932 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRN2Q92932 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRN2Q92932 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRN2Q92932 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRN2Q92932 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRN2Q92932 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRN2Q92932 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRN2Q92932 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRN2Q92932 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRN2Q92932 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRN2Q92932 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRN2Q92932 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRN2Q92932 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRN2Q92932 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRN2Q92932 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRN2Q92932 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRN2Q92932 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRN2Q92932 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRN2Q92932 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRN2Q92932 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRN2Q92932 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRN2Q92932 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRN2Q92932 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRN2Q92932 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRN2Q92932 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRN2Q92932 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRN2Q92932 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRN2Q92932 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRN2Q92932 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRN2Q92932 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRN2Q92932 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRN2Q92932 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRN2Q92932 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRN2Q92932 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRN2Q92932 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRN2Q92932 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRN2Q92932 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRN2Q92932 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRN2Q92932 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRN2Q92932 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRN2Q92932 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRN2Q92932 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRN2Q92932 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRN2Q92932 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRN2Q92932 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRN2Q92932 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRN2Q92932 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRN2Q92932 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRN2Q92932 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRN2Q92932 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRN2Q92932 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRN2Q92932 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRN2Q92932 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRN2Q92932 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRN2Q92932 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRN2Q92932 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRN2Q92932 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRN2Q92932 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRN2Q92932 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRN2Q92932 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms