Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7H5

PAF1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAF1Q8N7H5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAF1Q8N7H5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PAF1Q8N7H5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAF1Q8N7H5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAF1Q8N7H5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAF1Q8N7H5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAF1Q8N7H5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAF1Q8N7H5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAF1Q8N7H5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PAF1Q8N7H5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PAF1Q8N7H5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PAF1Q8N7H5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAF1Q8N7H5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAF1Q8N7H5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAF1Q8N7H5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PAF1Q8N7H5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAF1Q8N7H5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAF1Q8N7H5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAF1Q8N7H5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAF1Q8N7H5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAF1Q8N7H5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAF1Q8N7H5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAF1Q8N7H5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAF1Q8N7H5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAF1Q8N7H5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAF1Q8N7H5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAF1Q8N7H5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PAF1Q8N7H5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PAF1Q8N7H5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PAF1Q8N7H5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PAF1Q8N7H5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PAF1Q8N7H5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PAF1Q8N7H5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PAF1Q8N7H5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PAF1Q8N7H5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PAF1Q8N7H5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PAF1Q8N7H5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PAF1Q8N7H5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PAF1Q8N7H5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PAF1Q8N7H5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAF1Q8N7H5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAF1Q8N7H5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAF1Q8N7H5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAF1Q8N7H5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAF1Q8N7H5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAF1Q8N7H5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAF1Q8N7H5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAF1Q8N7H5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PAF1Q8N7H5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAF1Q8N7H5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAF1Q8N7H5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAF1Q8N7H5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAF1Q8N7H5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAF1Q8N7H5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAF1Q8N7H5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAF1Q8N7H5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAF1Q8N7H5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAF1Q8N7H5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAF1Q8N7H5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAF1Q8N7H5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAF1Q8N7H5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAF1Q8N7H5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAF1Q8N7H5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAF1Q8N7H5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAF1Q8N7H5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAF1Q8N7H5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAF1Q8N7H5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAF1Q8N7H5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAF1Q8N7H5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAF1Q8N7H5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PAF1Q8N7H5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAF1Q8N7H5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAF1Q8N7H5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAF1Q8N7H5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAF1Q8N7H5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAF1Q8N7H5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAF1Q8N7H5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAF1Q8N7H5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAF1Q8N7H5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAF1Q8N7H5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAF1Q8N7H5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAF1Q8N7H5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAF1Q8N7H5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PAF1Q8N7H5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAF1Q8N7H5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAF1Q8N7H5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAF1Q8N7H5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAF1Q8N7H5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAF1Q8N7H5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAF1Q8N7H5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAF1Q8N7H5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAF1Q8N7H5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAF1Q8N7H5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAF1Q8N7H5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAF1Q8N7H5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAF1Q8N7H5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAF1Q8N7H5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PAF1Q8N7H5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAF1Q8N7H5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAF1Q8N7H5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.5 ms