Protein–RNA interactions for Protein: Q86U17

SERPINA11, Serpin A11, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA11Q86U17 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPINA11Q86U17 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPINA11Q86U17 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPINA11Q86U17 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPINA11Q86U17 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPINA11Q86U17 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPINA11Q86U17 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPINA11Q86U17 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPINA11Q86U17 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPINA11Q86U17 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPINA11Q86U17 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPINA11Q86U17 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPINA11Q86U17 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERPINA11Q86U17 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERPINA11Q86U17 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERPINA11Q86U17 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERPINA11Q86U17 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERPINA11Q86U17 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERPINA11Q86U17 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERPINA11Q86U17 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERPINA11Q86U17 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SERPINA11Q86U17 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SERPINA11Q86U17 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SERPINA11Q86U17 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SERPINA11Q86U17 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SERPINA11Q86U17 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SERPINA11Q86U17 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SERPINA11Q86U17 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERPINA11Q86U17 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERPINA11Q86U17 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERPINA11Q86U17 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERPINA11Q86U17 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERPINA11Q86U17 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERPINA11Q86U17 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPINA11Q86U17 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPINA11Q86U17 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPINA11Q86U17 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPINA11Q86U17 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPINA11Q86U17 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPINA11Q86U17 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPINA11Q86U17 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPINA11Q86U17 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPINA11Q86U17 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPINA11Q86U17 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPINA11Q86U17 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERPINA11Q86U17 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERPINA11Q86U17 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERPINA11Q86U17 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERPINA11Q86U17 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERPINA11Q86U17 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERPINA11Q86U17 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERPINA11Q86U17 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERPINA11Q86U17 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERPINA11Q86U17 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERPINA11Q86U17 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERPINA11Q86U17 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERPINA11Q86U17 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERPINA11Q86U17 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERPINA11Q86U17 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERPINA11Q86U17 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERPINA11Q86U17 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPINA11Q86U17 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPINA11Q86U17 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPINA11Q86U17 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPINA11Q86U17 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPINA11Q86U17 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPINA11Q86U17 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPINA11Q86U17 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SERPINA11Q86U17 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SERPINA11Q86U17 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SERPINA11Q86U17 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SERPINA11Q86U17 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SERPINA11Q86U17 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERPINA11Q86U17 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERPINA11Q86U17 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERPINA11Q86U17 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERPINA11Q86U17 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERPINA11Q86U17 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERPINA11Q86U17 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERPINA11Q86U17 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERPINA11Q86U17 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERPINA11Q86U17 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERPINA11Q86U17 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERPINA11Q86U17 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERPINA11Q86U17 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERPINA11Q86U17 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERPINA11Q86U17 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SERPINA11Q86U17 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINA11Q86U17 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINA11Q86U17 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINA11Q86U17 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINA11Q86U17 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINA11Q86U17 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINA11Q86U17 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINA11Q86U17 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINA11Q86U17 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINA11Q86U17 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINA11Q86U17 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SERPINA11Q86U17 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SERPINA11Q86U17 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.1 ms