Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TMUB2Q71RG4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMUB2Q71RG4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMUB2Q71RG4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMUB2Q71RG4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMUB2Q71RG4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMUB2Q71RG4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMUB2Q71RG4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMUB2Q71RG4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMUB2Q71RG4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMUB2Q71RG4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMUB2Q71RG4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMUB2Q71RG4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMUB2Q71RG4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMUB2Q71RG4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMUB2Q71RG4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMUB2Q71RG4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMUB2Q71RG4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMUB2Q71RG4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMUB2Q71RG4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMUB2Q71RG4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMUB2Q71RG4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMUB2Q71RG4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMUB2Q71RG4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMUB2Q71RG4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMUB2Q71RG4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMUB2Q71RG4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
TMUB2Q71RG4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMUB2Q71RG4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMUB2Q71RG4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMUB2Q71RG4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMUB2Q71RG4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMUB2Q71RG4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMUB2Q71RG4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMUB2Q71RG4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMUB2Q71RG4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMUB2Q71RG4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMUB2Q71RG4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMUB2Q71RG4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMUB2Q71RG4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMUB2Q71RG4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMUB2Q71RG4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMUB2Q71RG4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMUB2Q71RG4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMUB2Q71RG4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMUB2Q71RG4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMUB2Q71RG4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMUB2Q71RG4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMUB2Q71RG4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMUB2Q71RG4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
TMUB2Q71RG4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMUB2Q71RG4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMUB2Q71RG4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMUB2Q71RG4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMUB2Q71RG4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMUB2Q71RG4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMUB2Q71RG4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMUB2Q71RG4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMUB2Q71RG4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMUB2Q71RG4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMUB2Q71RG4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMUB2Q71RG4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMUB2Q71RG4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMUB2Q71RG4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMUB2Q71RG4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMUB2Q71RG4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMUB2Q71RG4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMUB2Q71RG4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMUB2Q71RG4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMUB2Q71RG4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMUB2Q71RG4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMUB2Q71RG4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMUB2Q71RG4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMUB2Q71RG4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TMUB2Q71RG4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMUB2Q71RG4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMUB2Q71RG4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMUB2Q71RG4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMUB2Q71RG4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMUB2Q71RG4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMUB2Q71RG4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMUB2Q71RG4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMUB2Q71RG4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMUB2Q71RG4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMUB2Q71RG4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMUB2Q71RG4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMUB2Q71RG4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMUB2Q71RG4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMUB2Q71RG4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TMUB2Q71RG4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMUB2Q71RG4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMUB2Q71RG4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMUB2Q71RG4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMUB2Q71RG4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMUB2Q71RG4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMUB2Q71RG4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMUB2Q71RG4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMUB2Q71RG4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMUB2Q71RG4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMUB2Q71RG4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 258.9 ms