Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVL6

KIAA1549L, UPF0606 protein KIAA1549L, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549LQ6ZVL6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIAA1549LQ6ZVL6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIAA1549LQ6ZVL6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIAA1549LQ6ZVL6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIAA1549LQ6ZVL6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KIAA1549LQ6ZVL6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIAA1549LQ6ZVL6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIAA1549LQ6ZVL6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIAA1549LQ6ZVL6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIAA1549LQ6ZVL6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIAA1549LQ6ZVL6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIAA1549LQ6ZVL6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIAA1549LQ6ZVL6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KIAA1549LQ6ZVL6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIAA1549LQ6ZVL6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIAA1549LQ6ZVL6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIAA1549LQ6ZVL6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIAA1549LQ6ZVL6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIAA1549LQ6ZVL6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIAA1549LQ6ZVL6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIAA1549LQ6ZVL6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KIAA1549LQ6ZVL6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIAA1549LQ6ZVL6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIAA1549LQ6ZVL6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIAA1549LQ6ZVL6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIAA1549LQ6ZVL6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIAA1549LQ6ZVL6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIAA1549LQ6ZVL6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIAA1549LQ6ZVL6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KIAA1549LQ6ZVL6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIAA1549LQ6ZVL6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIAA1549LQ6ZVL6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIAA1549LQ6ZVL6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIAA1549LQ6ZVL6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIAA1549LQ6ZVL6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIAA1549LQ6ZVL6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIAA1549LQ6ZVL6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIAA1549LQ6ZVL6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIAA1549LQ6ZVL6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIAA1549LQ6ZVL6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIAA1549LQ6ZVL6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIAA1549LQ6ZVL6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KIAA1549LQ6ZVL6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIAA1549LQ6ZVL6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIAA1549LQ6ZVL6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIAA1549LQ6ZVL6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KIAA1549LQ6ZVL6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KIAA1549LQ6ZVL6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIAA1549LQ6ZVL6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIAA1549LQ6ZVL6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIAA1549LQ6ZVL6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIAA1549LQ6ZVL6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIAA1549LQ6ZVL6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIAA1549LQ6ZVL6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIAA1549LQ6ZVL6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIAA1549LQ6ZVL6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIAA1549LQ6ZVL6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KIAA1549LQ6ZVL6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KIAA1549LQ6ZVL6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIAA1549LQ6ZVL6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIAA1549LQ6ZVL6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIAA1549LQ6ZVL6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIAA1549LQ6ZVL6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIAA1549LQ6ZVL6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIAA1549LQ6ZVL6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIAA1549LQ6ZVL6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIAA1549LQ6ZVL6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIAA1549LQ6ZVL6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIAA1549LQ6ZVL6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIAA1549LQ6ZVL6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIAA1549LQ6ZVL6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIAA1549LQ6ZVL6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIAA1549LQ6ZVL6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIAA1549LQ6ZVL6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIAA1549LQ6ZVL6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIAA1549LQ6ZVL6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KIAA1549LQ6ZVL6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KIAA1549LQ6ZVL6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KIAA1549LQ6ZVL6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KIAA1549LQ6ZVL6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KIAA1549LQ6ZVL6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KIAA1549LQ6ZVL6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KIAA1549LQ6ZVL6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIAA1549LQ6ZVL6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIAA1549LQ6ZVL6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIAA1549LQ6ZVL6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KIAA1549LQ6ZVL6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIAA1549LQ6ZVL6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIAA1549LQ6ZVL6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIAA1549LQ6ZVL6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIAA1549LQ6ZVL6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIAA1549LQ6ZVL6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIAA1549LQ6ZVL6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIAA1549LQ6ZVL6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIAA1549LQ6ZVL6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KIAA1549LQ6ZVL6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIAA1549LQ6ZVL6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIAA1549LQ6ZVL6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIAA1549LQ6ZVL6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIAA1549LQ6ZVL6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms