Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUI8

C19orf48, Uncharacterized protein C19orf48, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf48Q6RUI8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C19orf48Q6RUI8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C19orf48Q6RUI8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C19orf48Q6RUI8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C19orf48Q6RUI8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C19orf48Q6RUI8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C19orf48Q6RUI8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C19orf48Q6RUI8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C19orf48Q6RUI8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C19orf48Q6RUI8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C19orf48Q6RUI8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C19orf48Q6RUI8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C19orf48Q6RUI8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C19orf48Q6RUI8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C19orf48Q6RUI8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C19orf48Q6RUI8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C19orf48Q6RUI8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C19orf48Q6RUI8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C19orf48Q6RUI8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C19orf48Q6RUI8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C19orf48Q6RUI8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C19orf48Q6RUI8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C19orf48Q6RUI8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C19orf48Q6RUI8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C19orf48Q6RUI8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C19orf48Q6RUI8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
C19orf48Q6RUI8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C19orf48Q6RUI8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C19orf48Q6RUI8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
C19orf48Q6RUI8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C19orf48Q6RUI8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C19orf48Q6RUI8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C19orf48Q6RUI8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C19orf48Q6RUI8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C19orf48Q6RUI8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C19orf48Q6RUI8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
C19orf48Q6RUI8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C19orf48Q6RUI8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C19orf48Q6RUI8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C19orf48Q6RUI8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C19orf48Q6RUI8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C19orf48Q6RUI8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
C19orf48Q6RUI8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C19orf48Q6RUI8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C19orf48Q6RUI8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C19orf48Q6RUI8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C19orf48Q6RUI8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C19orf48Q6RUI8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C19orf48Q6RUI8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C19orf48Q6RUI8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C19orf48Q6RUI8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C19orf48Q6RUI8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C19orf48Q6RUI8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C19orf48Q6RUI8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C19orf48Q6RUI8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C19orf48Q6RUI8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C19orf48Q6RUI8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
C19orf48Q6RUI8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C19orf48Q6RUI8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C19orf48Q6RUI8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C19orf48Q6RUI8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C19orf48Q6RUI8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C19orf48Q6RUI8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C19orf48Q6RUI8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C19orf48Q6RUI8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C19orf48Q6RUI8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C19orf48Q6RUI8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C19orf48Q6RUI8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C19orf48Q6RUI8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C19orf48Q6RUI8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C19orf48Q6RUI8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
C19orf48Q6RUI8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C19orf48Q6RUI8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C19orf48Q6RUI8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C19orf48Q6RUI8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C19orf48Q6RUI8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C19orf48Q6RUI8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C19orf48Q6RUI8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C19orf48Q6RUI8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C19orf48Q6RUI8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C19orf48Q6RUI8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C19orf48Q6RUI8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C19orf48Q6RUI8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C19orf48Q6RUI8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C19orf48Q6RUI8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C19orf48Q6RUI8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C19orf48Q6RUI8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
C19orf48Q6RUI8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C19orf48Q6RUI8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C19orf48Q6RUI8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C19orf48Q6RUI8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C19orf48Q6RUI8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C19orf48Q6RUI8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C19orf48Q6RUI8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C19orf48Q6RUI8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C19orf48Q6RUI8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C19orf48Q6RUI8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C19orf48Q6RUI8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C19orf48Q6RUI8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C19orf48Q6RUI8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms